DNA合成仪有不同的类型，包括实验室型、工业型和大规模合成型。实验室型合成仪主要用于生物实验室中，而工业型合成仪主要用于大型生物实验室以及商业机构中。大规模合成司则主要用于生物医药原料药制备领域，可以进行规模化量产。
用于和DNA或RNA结构类似的寡核苷酸合成的自动化仪器，即是DNA合成仪。通常用于固相合成法，每次在长的寡核苷酸链上接入一个核苷酸。加入每一个核苷酸均通过相同的化学反应和相应的**或嘧啶碱基衍生物作用。仪器不同，所用化学反应和操作细节也会随之发生变化。DNA合成的磷酸酰胺法得到了广泛的应用。
DNA合成仪一般需碱基瓶组及试剂瓶组。试剂瓶组一般最少为6个，含脱保护剂（Deb）、活化剂（act）、盖帽试剂A（capA）、盖帽试剂B(capB)、氧化剂（OXI）及洗脱乙腈（ACN），每种仪器一般都多设置1-2个试剂瓶位，用于特殊产物的合成。碱基瓶组一般最少为4个标准碱基（A/C/G/T）,同时搭配2-多个特殊碱基瓶位，用于荧光标记等合成。
DNA 合成仪采用一定压力的惰性气体(氩气)或氮气及电磁阀组驱动液体试剂，也可采用氦气驱动试剂。某些合成仪采用slider block滑块系统及精密蠕动泵，可不采用气体为驱动系统。采用气体及电磁阀驱动液体试剂时，需先将管路系统电磁阀前段，含试剂瓶组中压力加压到规定气压，通过合成管理软件或手动打开电磁阀(一般打开时间为数ms)，即可驱动液体试剂到所需的合成柱中。
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